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HL-SAN耐高盐核酸酶,高效去除宿主DNA

发布日期:2024-01-11 浏览量:118

无论是实验室规模样品制备、还是生产规模工艺过程,去除核酸都可以改善工艺流程,如蛋白纯化、病毒载体制备、mNGS中样品处理等过程。而核酸酶的选择,就显得特别重要。Heat Labile-Salt Active Nuclease (热不稳定性耐高盐核酸酶,HL-SAN) 是一种非特异性内切酶,在高盐浓度下具有最佳活性;且该酶在多种缓冲液中都有活性,很容易通过还原剂处理而失活。这些特性使HL-SAN在需要去除DNA和RNA的应用中,更为适合。核酸污染,特别是宿主基因组DNA污染,在几乎所有工艺流程及生物制品的生产中,都是需要重点解决的问题。一方面,宿主DNA的存在,影响目标产物的纯化及下游质量分析等。另一方面,宿主DNA残留能引起机体严重的免疫反应,是生物制品的关键质量参数之一,FDA及NMPA等对Host Cell DNA (HCD)有严格的质控要求。宿主基因组DNA中,组蛋白与DNA形成核小体,核小体紧密折叠形成结构复杂的染色质。组蛋白与DNA间存在强烈的离子作用及疏水作用,再加上特殊的结构,导致宿主DNA很难被准确检测并清除。已有文献表明,高盐浓度下组蛋白与DNA解离相对彻底,这有利于宿主DNA的检测及去除。但市售的绝大多数核酸酶在高盐浓度下活性很弱,甚至完全失活。而耐高盐的HL-SAN成了这类应用的理想选择。

一,逐典耐高盐全能核酸酶优势

1.更高盐耐受度

当盐离子浓度在600~700mM时,初代全能核酸酶几近失活,而SAN仍能保持较高活性。

图1.不同盐浓度下耐高盐全能核酸酶(SAN)与初代全能核酸酶活性对比

2. 高效核酸降解力

同对照组相比,添加SAN后能够有效去除核酸残留。

图2 加入SAN 前后的消化效果图

二,逐典耐高盐全能核酸酶用途

1.疫苗和病毒样品制备中高盐环境下DNA污染的去除

2.与细胞或细菌裂解液配合使用,去除粗提物中的核酸,降低溶液粘性,提高蛋白质产量。

3.减少存放的外周血单细胞(PBMC)的结块现象

4.降解核酸,利于不可溶性蛋白复性前高质量包涵体制备。

5.有效去除带负电荷的核酸对双向SDS-PAGE蛋白样品的影响,改善蛋白质分离效果,增强2-DE分辨率

三,使用指导

1. DNA去除方案

从细胞抽提物或细胞裂解液中去除DNA污染,HL-SAN的使用量受到多种因素影响,如细胞类型、裂解液组成、NaCl浓度、Mg2+浓度、裂解液pH等。参考方案见Figure 1。比如,对于1ml细胞裂解样品,调整到0.3-0.75 M NaCl浓度,加入1000 U HL-SAN,15℃-37℃温度条件下孵育30-60min,或者4℃过夜。Mg2+是必须的。

2.灭活

灭活是通过添加还原剂(TCEP或DTT)来实现的,推荐用TCEP(因为TCEP在磷酸盐溶液中不稳定,特别在中性pH下)。不同工艺流程中,通过改变孵育时间、温度和还原剂的浓度等来灭活该酶。一般情况下, 25-37℃反应5-10分钟,可以灭活99%以上的酶。为了避免酶恢复活性、再次激活,保持低浓度还原剂,如0.1-0.5 mM DTT或TCEP,或延长灭活反应时间。

四,客户之声

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